小動物外科

         外科醫療服務除一般外科/軟組織外科外，另有次專科目前有骨科/整形重建外科、眼科、牙科、神經外科以及針灸/神經復健科。

一般外科/軟組織外科

由資深獸醫師帶領，診治胸腔、腹腔、泌尿系統等外科疾病。

骨科/整形重建外科

        由教授獸醫師帶領，診治骨折、關節疾病以及創傷重建。骨科服務在於處理骨折的問題、骨頭和關節的疾病、跛行等等。夲科之醫師群提供來自各地病患的骨科疾病完整的診斷治療服務。骨科之教學訓練指導醫師為葉力森醫師。

眼科

由教授獸醫師帶領，診治一般眼科疾病以及眼科轉診病例，提供專業診斷及治療。

        動物眼科部針對動物或犬貓眼睛的疾病提供高品質專科的診斷、手術、和治療的服務。本科之醫師群提供來自全省各地病患的各種眼睛疾病完整且仔細的診斷治療服務，例如青光眼、白內障、角膜問題、視網膜疾病、感染性疾病、腫瘤、乾眼症和眼瞼異常等。本科例行經常性進行之臨床業務及手術，包括小切口白內障摘除超音波乳化手術(phacoemulsification)、眼角膜修復重建顯微手術(corneal microsurgery)、動物人工義眼植入手術(intraocular prosthesis implantation)、青光眼之內外科療法、視網膜電波圖(electroretinography)診斷動物視力功能、眼科雷射手術 (ocular laser surgery)、眼科超音波(ocular ultrasonography)、以及利用特殊度數之眼鏡矯正改善動物之視力(corrective lens for animals)等各種動物眼科疾病之診治。眼科部門之教學訓練指導醫師為林中天醫師。

牙科

         服務提供專業的牙科治療及手術，包括口腔及牙科學檢查、數位牙科x光片拍攝、專業牙周治療、口炎與牙周疾病之評估及治療、拔牙、補綴、根管治療、齒模製作與贗復等技術，以及口鼻瘻管修補與牙齦瓣移植治療，並且由牙科醫師提供專業的口腔保健諮詢及建議。

神經專科門診

         由獸醫神經學專科醫師（Diploma of European College of Veterinary Neurology）帶領住院醫師與研究生，負責小動物神經外科與神經內科疾病的診斷與治療包括腦與脊髓疾病的診治、磁振造影（MRI）與斷層掃瞄（CT）於神經系統的應用與判讀、退化性椎間盤疾病診斷與手術、癲癇診斷與治療及小動物臨床神經學教學等。神經科團隊已幫助許多動物恢復神經功能及重新擁有良好的生活品質。